关于墓祭，孔氏族人是这样理解的：“墓祭非古，谓是先人体魄所藏而精神所聚也。然尧祠、灵台、武王祭毕，古人已有行之者矣，不自三代下始也。且祭之为道，在申其哀敬而已，安见体魄所藏，不可以达我之忱乎？况随时展视，使兆域不荒，松楸无恙，庶几我先人得永安于地下，亦仁人孝子所不废也。”（《孔氏家仪·卷三》）孔林墓祭有多种类型，大可分为有官方组织的公祭、家族组织的家祭和家庭个体立碑时的拜谒致祭三种。
△孔府照片
公祭，主要是对孔子墓的祭祀。孔子墓是孔林墓祭的核心，历来不但受到孔氏家族的祭拜，还受到皇族、权贵、文人墨客等外界人士的重视。当然，历史上对孔子的祭拜活动大多是在孔庙内举行的，孔子墓多为人们瞻仰圣迹的场所。尽管如此，史上仍不乏有关皇族对孔子墓祭祀的记载，而其他非族人的墓祭活动则难以统计。
△孔府照片
孔子去世后，虽然史籍中有“鲁人世以岁时奉祀孔子冢”的记载，但规制、礼仪并不十分清晰。至东汉桓帝永寿三年（157年），鲁相韩敕修孔子墓，墓前造神门一间，东南造斋厅三间，易旧祠坛，安排民户以给扫除，是已知孔子墓祭为官方推举提倡之始。其墓祭规制必然具有了一定的规模，并具有了可以遵循的规律性。参考汉时孔子庙以太牢致祭，那么，凡墓祭其礼仪亦应用太牢之礼，或略简。以后有史料记载的北魏孝文帝太和十九年（495年）夏四月，“帝幸鲁，亲祠孔子，诏兖州为孔子（墓）起园。”说明孝文帝至孔子墓拜谒；唐玄宗开元十三年（725年）冬十一月，帝李隆基幸孔子宅，遣礼部尚书苏颋以太牢祭孔子墓，拨近墓五户长供扫除；后周太祖广順二年（952年）夏六月，帝郭威幸曲阜，拜孔子墓，勅禁樵采；宋大中祥符元年（1008年），宋真宗东封泰山过曲阜，以太牢之礼谒孔子墓，又给近便十户奉茔域；徽宗宣和元年（1119年），遣祭，命工以王侯之制造石仪立于墓前，丰富了墓祭的文化内涵。
以上墓祭礼仪皆不详。
清代康熙、乾隆二帝拜谒孔子墓的记载最为详尽，分别是在康熙二十三年（1684年），乾隆十三年（1748年）、二十一年（1756年）、二十二年（1757年）、二十七年（1762年）、五十五年（1790年）。
康熙二十三年，圣祖玄烨在孔庙祭祀孔子后的第二天，御常服到孔林拜孔子墓。随行的王公大臣等官员提前到孔林门外下马，然后步行至孔子墓墓门前恭候；驾光禄寺堂官布置祭所，将爵案、奠池设于孔子墓前月台的正中；武备院官设拜褥。陪从皇帝的大臣、侍卫官一行至孔林门外下马，步行随皇舆进入。过洙水桥至墓门，皇帝降舆，礼部堂官前导由中门入至墓所；鸿胪寺官引王公以下三品文武大臣、待卫官员随后进入，分列在墓前享殿外两旁。
皇帝升月台诣拜褥，跪，众皆跪。执事官酌酒，大臣跪进爵。皇帝酹酒，三爵，每爵行一叩头礼，众皆随行礼。礼毕，王公大臣等先出，礼部堂官前导皇帝由中门出，升舆还临时行宫。
乾隆皇帝谒拜孔子墓的礼仪与康熙帝大致相同，其中有一次行宫设在今古泮池内，不再陈述。
家祭，是指以户族家庭为单位的林地至祭。此墓祭是随着历史的进程而发展演变的，其家祭活动亦受历史环境的制约。除约定成俗的葬后三日坟成墓祭外（俗称“筑坟”），史料记载，宋金时期亦有清明和十月一两次致祭。明代时，由于皇帝的陵墓实行的是每年三祭，孔氏族人的墓祭亦为“每岁之清明节、七月望（中元）、十月朔，并诣墓祭扫。”一直延续到清中期改为每年清明、农历十月一两次祭。改祭的原因，《孔氏家仪》中是这样解释的：“墓次中元之祭，本有释教，今沿习旧俗而行之。虽不设齐醮，终非法也。乾隆辛巳秋七月，今宗子告宗族百司曰‘中元设祭，古礼所无。自唐时始有其事，而或云：目连救母；设盂兰盆会，或云：地官建元都大醮，其语皆出于释老两家。渎祠不经，有乖祀典，其改祖庙中元一祭于中秋，庶不违礼诬祖，是庙祭固已正矣。’窃谓中元墓祭，亦所当议革者，未可拘有举莫废之义也。”
大宗户宗主祭扫的范围原则上是，“凡庙中有主者，皆祭焉”，但从有关史料查寻，除先祖孔子、孔鲤、孔伋，中兴祖孔仁玉外，大多仅祭祀自己的近祖，即所谓高、曾祖以下四代。在乾隆六十年（1795年）八月的一天，发现了孔子十九代孙孔君墓后，始为该墓专设祭坛，每年随祀。同时又特别指出，近祖则遇诞辰、忌辰皆祭于墓。
每年清明、农历十月一两次祭扫之仪为：预设牲俎、祭品及樽爵、罍洗于各墓前，衍圣公率族人到孔林，有执事、礼生随行，先至孔子墓。
（鸣唱）：“排班！”列序班齐。“跪！”“伏！兴！”，衍圣公以下行一跪三叩头礼，礼毕，站立。“奠帛！”“行献礼！”
（引唱）：“升坛！”“浴手！”“进巾！”“洗爵！”“进巾！”“诣酒樽所！”司樽者举羃酌酒。“诣圣墓前！跪！”衍圣公跪。
（鸣唱）：“皆跪！”族人皆跪。
（引唱）：“进帛！”“献帛！”“进爵！”“献爵！”“伏！兴！”衍圣公献帛、爵，行一叩头礼，族人随行，“复位！”衍圣公复位。
（鸣唱）：“跪！”“伏！兴！”全体族人行一跪三叩头礼。礼毕。
随后至二世祖墓、三世祖墓、庐墓堂、中兴祖以及衍圣公高、曾祖祢（nǐ）墓，逐个依次祭扫，奠帛、酌献皆如前仪。这一天，孔庭族长还要到“启圣林”（梁公林）祭扫，如前仪。
诞辰、忌辰墓祭之仪为：墓前陈羊、豕、肴馔，主人素服就位。执事者进香，主人上香，鞠躬，拜，兴，跪。执事者跪，进酒，主人酹酒。执事者奉壶再斟酒，主人拱举，授执事者，执事者受，兴，奠于案，退。主人再拜，兴，礼毕。
特别需要指出的是，只有每年清明、农历十月一两次扫墓，主妇才有机会前往孔林奠祭。其他诞辰、忌辰之祭，皆拜于祠堂。凡族中其他宗户祭墓，各并如上仪。
另外还有一种墓祭形式称之为“泛祭”，即对葬入孔林的族人无后者及殇者的祭祀。祭坛在孔子墓享殿偏东，谓之“悯无主者也”，反映出孔氏族人间的泛爱与亲情。此祭没有固定的仪式与人员，属自愿的一种墓祭形式，大凡孔氏族人都可以参加。《孔氏家仪》是这样解释的：“古礼，上殇葬以棺椁，中下殇葬以塈周，无服之殇葬以瓦棺，无分适庶，皆既虞，卒哭而附。《开元礼》：‘三殇之丧，事辨而葬，不立神主。既虞，除灵而适殇。庶子之适殇，犹附如礼。’《政和礼》又云：‘适殇者时享，皆祔食。’古来祭殇之礼，不一而成。人无后者，独不言然。据《殇之祔食》与《丧大记》：有无后，无无主之义，则成人无后者应祔食，可推。而程子为祭之等云：‘无服之殇不祭，中殇之祭终兄弟之身，长殇之祭终兄弟之子之身，成人无后者其终兄弟之孙之身。今世无后者、殇者并阙祔食之礼。’吾家旧于祭扫之日，宗子除坛、设祭以恤孤魂，意良厚矣夫。”可见，泛祭之俗由来已久。
作为曲阜本地的孔氏族人，大可遵循墓祭之礼。但也有些在异乡谋生的孔氏后裔，有的甚至在外定居多年，父辈已另择墓地，只是祖上墓冢在此，不可能每每回祭。为了规范墓祭这一庄严行为，《孔氏家仪》规定：“凡子孙外出为官，请假回籍省墓者，往祭于先人之墓，如树碑碣之仪。已属支庶，则告于其宗，为之代祭。”
立碑墓祭，是指有一定社会地位和经济能力人丧家，为逝者立碑以示时的一种祭祀。按照礼仪传统，既葬，即墓前为坛，宜于除服之后，择日立碑碣以志。旧时碑、碣有别，世人必须恪遵当朝制定的碑碣制度。明清时期，五品以上的称之为碑，六品以下称之为碣，碑碣大小也有着明确的规定（详见碑刻篇）。立碑碣时必有祭，祭属古礼之中的“吉礼”。
立碑竭之日早晨，先把打制完好的碑碣陈于墓前，拜位及客坐依次设好。此时，丧主着吉服，告于家庙、祠堂，其告文曰：“维年月日孝子某等（孙承重者曰孝孙某等）敢昭告于显考某府君神位前，曰：某等谨涓今日，实惟吉辰，敬树丰碑（树碣曰华碣），用表尊茔，敢告！”告毕，换素服与全体家属成员齐聚林内，鞠躬，四拜。
工役树碑碣完毕，来宾依次各至墓前拜，丧主位东西面陪拜。礼毕，主人拜宾，宾退至一旁。执事者陈羊、豕、祭品、尊罍，陈设完毕，主宾归于拜位。仪如家祭：执事者各司其事，主人就位，众宾、众子弟皆就位。执事者瘞毛血，迎神，主人诣盥洗所盥手，完毕，升坛，跪，众皆跪。主人上香，酹酒，俯伏，兴，众皆俯伏，兴。主人复位，执事者设馔，完毕，参神，主人及众皆鞠躬，四拜，兴，行初献礼。主人诣盥洗所洗爵，升坛，诣酒尊所，司尊者举羃，酌酒。主人至墓前，跪，众皆跪。司爵者进爵，主人受爵，拱举，复授司爵者。司爵者受，兴，奠于案，退。祝跪，读祭文，曰：“丰碑屹立，表于百世，礼既告成，不胜感怆。尚飨！”读毕，奉祝文恭安案上，俯伏，兴，退。主人俯伏，兴，众皆俯伏，兴。主人复位，行亚献礼如初献，行终献礼如亚献。执事者彻馔，退，送神。主人及众皆鞠躬，四拜，兴。祝恭奉祝文诣燎位，主人望燎，复位。礼毕，主人拜宾，宾退，主人复拜。
△至圣林坊
衍圣公在世时常常深受朝廷的优渥，卒后也是，或下诏立碑，或遣官致祭。凡遇到此种情况，要设棚次承祭，其仪与府内谕祭之仪相同（见丧葬篇）。
墓祭作为一种传统礼俗，代代相沿。它的发展过程中，蕴含了古人丰富的人文理念和价值观，把生死两界通过墓祭形式紧密地贯通起来，使得生死轮回中我中有你、你中有我。孔林由于孔氏家族人口众多，社会地位高低不等，故而形成了墓祭时节，成员相对集中、规模浩大、形式多样、礼仪讲究、祭品丰厚的场景，可谓是中国最为正统和典型的墓祭大典。
△清末照片